Vagina, mukoza ve düz kas liflerinden yapılmış bir kanaldır. Kanalın iç yüzünü mukoza örtmektedir. Mukozanın vagina boşluğuna bakan tabakası "çok katlı skuamöz epitel" dokusudur. Bunun altında ise gevşek bağdokusu bulunur. En dışta ise düz kas lifleri vardır. Vagina mukozasında salgı bezleri bulunmaz. Vaginanın nemliliğini vulvadan ve rahim boynundan gelen salgüarla vagina damarlarından sızan sıvılar sağlar. Mukozadaki epitel hücrelerinde glikojen bulunur. Yaşlanıp vagina boşluğuna düşen bu hücrelerdeki glikojen maddesi, vaginada normal olarak bulunan "Döderlein basilleri" adlı bakteriler tarafından laktik asite dönüştürülür. Böylece vagina pH'mm asit olması sağlanır. Vagina içinin asit oluşu da, onu çeşitli mikrobik hastalıklara (infeksiyonlara) karşı koruduğu gibi, dış ortamtaki mikropların rahime bulaşmasını önleyen önemli bir etkendir. Ergenlik öncesi kızlarda ve adetten kesilmiş kadınlarda, şeker hastalığı olanlarda, ateşli ve bazı hastalıklarda, gebelik gibi durumlarda vaginanın epitel hücrelerinde daha az glikojen bulunması nedeniyle daha az laktik asit hazırlanır ve bu koruyucu ortam bozulur. Bu nedenle vagina pH'ı 6.8-7.2 gibi hafif asit - hafif baz sınırları arasında kalır. Bu durumda ise vaginayı mikrobik hastalıklara duyarlı kılar. Ancak erişkin kadınlarda vagina epiteli fazla miktarda glikojen içerdiğinden, döderlein basilleri tarafından daha fazla laktik asit hazırlanır ve kadınların vaginasmdan pH 4-5 düzeyine, yani asite döner. Bu durum kadının sağlığı açısından çok yararlıdır. Vagina derisindeki hücrelerin düzeni, her ay kadınlarda görülen hor-monal değişimlere uygun olarak periyodik farklılıklar gösterir. Bu nedenle, dölyolundan alınan akıntının mikroskopla incelenmesiyle dölyolu derisinden dökülen bu hücrelere bakarak, o kadının hormonal düzeniyle ilgili bilgi edinilebilir. Normalde vaginada, bez bulunmadığı halde, döl-yoluna nemlilik veren ve bir yakınmaya yol açmayan beyaz bir akıntı (Flour albus) vardır. Bu akıntı,rahim ağzı bezlerinin salgısı, dölyolu derisinden sızan sıvı ve dökülen hücrelerden oluşur.