Vaginada enine ya da uzunlamasına bulunan bölmeler doğumsal bir yapı bozukluğu olup, kısırlık nedenleri arasındadır. Bu bölmelerin ameliyatla ortadan kaldırılmasıyla kadının gebe kalması sağlanabilir. Uzunlamasına olan bölmelerin ameliyatla düzeltilmesi mutlaka gerekli değildir. Eğer cinsel birleşmeye engel olacak biçimde ise operasyon uygulanır. Enine, olan bölmeler ise mutlaka ameliyatla düzeltilmelidir.
Bazı kadınlarda da vagina hiç yoktur ya da bir girinti biçimindedir. Böyle kadınlara plastik ameliyatlarla yapay bir vagina yapmak mümkündür. Ancak bu kadınların diğer üreme organları normalse bu ameliyatlar sonucunda çocuk sahibi olabilme şansları vardır. Fakat genellikle diğer üreme organları da gelişmemiş olduğundan yapılan bu yapay vagina sadece cinsel birleşmeyi sağlar.